阴阳五行学说与印度的四大说的关系，有两种不同观点，一是认为中医的阴阳五行学说与印度的四大说不同，[ 李经纬：《中外医学交流史》，长沙：湖南教育出版社，1998年版急，第18页。]一种观点认为中医的阴阳五行学说与印度的四大说是相似的，[ 薛公忱主编：《儒佛道与中医药学》，北京：中国书店，2002年版，第564页。]都是对世界物质的抽象认识，并影响医学领域。
由上可知，佛教医学所认为的“人用四大成身，一大有一百一病”，此“四大”学说和“百一”理论与中医学的阴阳五行学说有异曲同工之妙，都认为人与天地相应，世上一切事物都是生擞配幻的。印度《吠陀》中认为“水为一切之母，邃古之初，唯“水”而已。”而在《管子·水地篇》：“水者，……万物之本源也，诸生之宗室也。”“风即气，印度四大之风，梵文为Vāyu.Vedāntanta﹣sāra中所谓人体之五风，其首之Pārna实即气也。风之为气，中印之说悉同，《齐物论》云：‘大块噎气，其名曰风。’”[饶宗颐：《佛教渊源论》，见《饶宗颐二十世纪文集》第5卷，台北：台北新文风出版社2003年版，第248-250页。]可见印度佛教认为地、水、火、风是构成世界万事万物的本源，相互影响存在辩证统一的关系，上升到一种哲学的抽象的理性认识，进而影响到医学领域。这与中国的阴阳五行学说类似，医学中的五行，已不仅仅是指五种实物的本体，而是从认识事物的本质抽象出来的理性知识，进而而成为分析事物相互关系的一种方法。正是因为二者的相似性，当时以及后来的医家尝试将二者有机的结合起来，虽然由于中医理论体系本身的完整性以及其对临床实践的指导作用，“四大”说最终未能纳入中医理论体系之中，但是依然可见四大说对于当时中医学说得冲击，并为广大医家所认同，并试图与中医中的五行学说相结合的尝试。
三、治疗方法具有类似之处
佛教医学和中医学在具体的临床治疗方面，都普遍的运用咒语和针灸等，这也是佛教医学为当时任所接受的一个重要原因。
首先，咒语的运用。佛教自西汉末年传入中国之后，未能遽显，故魏晋以前史书中涉及佛教的记载少有出现。究其原因，正如汤用彤先生所说：“考伊存授经，明帝求法以后，佛教寂然无所闻见。然实则其时，仅为方术之一，流行民间，独与异族有接触（如博士弟子景卢），及好奇之士（如楚王英襄楷），乃有称述，其本来面目，原未显著。当世人士不过知其为夷狄之法，且视为道术之流。”[汤用彤：《汉魏两晋南北朝佛教史》，上海：上海书店1991年版，第57页。]佛教后来之流行，实借助医卜等术，汤用彤先生认为：“自汉通西域，佛教入华以来，其始持精灵报应之说，行斋戒祠祀之方，依傍方术之势，以渐深入人民间。”[汤用彤《汉魏两晋南北朝佛教史》，上海：上海书店1991年，第188页。]吕思勉先生也认为：“然溺于迷信，特其时沙门见信敬之一端；其又一端，则亦以是时沙门多有学艺也。周朗痛陈佛教之弊，谓其假医术，讬卜术，足见其流衍民间，实以二者为慿藉。”[吕思勉：《吕思勉读史札记》，上海：上海古籍出版社1982年版，第966页。]“自释氏流教，其来有源，渊检精测，固非深矣。舒引容润，既亦广矣。然习慧者日替其修，束诫者月繁其过，遂至糜散锦帛，侈饰车从。复假精医术，讬杂卜数，延姝满室，置酒浃堂，寄夫托妻者不无，杀子乞儿者继有。”[（梁）沈约：《宋书》卷82《周朗传》，北京：中华书局1974年版，第2100页。]周朗所说“虽是南朝佛教流行之情况，但两晋南北朝佛教之大盛当不无渊源，其传教之方法，应是袭汉世旧窠。”可见，佛教是被作为方技之术为当时人所接受，这与中国土生土长的道教方士之术存在有类似之处。
如上所述，我国医学一直与巫术有着某种程度的联系，在古代医疗中，巫术可以说是不可少的一部分。如唐代《千金翼方》中就有咒禁法，唐代太医署中首次设立咒禁科，设有咒禁播时，即是当时咒禁盛行的结果。然而印度佛教常用的咒禁法也是随着佛教在中国的盛行而流传的，其在僧医的治疗中有着重要的作用，如晋竺法旷 “时东土多遇疫疾，旷既少习慈悲，兼修神呪。遂游行村裡，拯救危急，乃出邑止昌原寺，百姓疾者，多祈之致效。”[（梁）释慧皎：《高僧传》卷5《晋于潜青山竺法旷》，北京：中华书局1992年版，第205页。]宋求那跋陀罗 “幼学五明诸论，天文书算，医方呪术，靡不该博” 。[（梁）释慧皎：《高僧传》卷3《宋京师中兴寺求那跋陀罗》，北京 中华书局1992年版，第130页。]这种带有神秘色彩的治疗与中国古代的医学中的祝由存在相同之处，亦成为世人接受佛教医学的原因之一。
其次，针灸术中印皆有。春秋时，针砭可能已经出现，有“伏牲制九针”的传说，《山海经·东山经》载，“高氏之山……其下多箴石”。郭璞注云：“砭针，治痈肿者”。山东省微山县出土东汉画像石上的针灸图，据考证可能是战国时神化的扁鹊的针灸图。针灸在《黄帝内经》中已经普遍应用。关于针灸术的传入，陈竺同在《汉魏南北朝外来的医术与药物的考证》中“针灸治疗与医书托古”一节论述已经很详细。[陈竺同：《汉魏南北朝外来的医术与药物的考证》，《暨南学报》,第1卷第1号，1936年。]
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