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三种不同引物扩增对猪圆环病毒2型检测敏感性的研究(2)

时间:2018-08-02 13:17来源:毕业论文
ORF2基因是决定PCV2的主要免疫原的基因,也是对其进行PCR鉴别诊断的首选基因[3]。根据GenBank已公布的ORF2序列,应用Primer Premier 5.0引物设计 软件 可以设计扩


    ORF2基因是决定PCV2的主要免疫原的基因,也是对其进行PCR鉴别诊断的首选基因[3]。根据GenBank已公布的ORF2序列,应用Primer Premier 5.0引物设计软件可以设计扩增引物进行PCR检测,但不同的PCR方法所分析的基因序列区间及检测用引物、扩增片段大小各不相同,特异性和敏感性不一,有时会因病毒污染的程度小而检测不出抗原。为了避免假阴性情况的发生,应根据实际情况选择特异性强、敏感度高的扩增引物。
目前,生产实践中常用的猪圆环病毒PCR方法检测引物有:国家标准引物,有3条,采用多重PCR方法,可以区分PCV1与PCV2[4];出入境检验检疫标准引物,有4条,所用方法为巢式PCR,可以区分PCV1与PCV2[5]。本实验拟自主设计一对引物,应用普通PCR方法检测猪圆环病毒2型,并与国家标准引物、出入境检验检疫标准引物进行特异性、敏感性方面的对比验证,以筛选更理想的PCR引物,为疫苗质量监控过程中检测PCV2外源病毒的方法优化及临床快速诊断PCV的方法优化奠定基础。
1  材料与方法
1.1  材料
1.1.1  主要仪器
CO2培养箱,购于Forma公司;荧光倒置显微镜,购于Olympus公司;PCR仪,购于Eppendorf公司;UV-2000紫外分析仪,购于上海嘉鹏科技有限公司;移液器,购于Eppendorf公司。
1.1.2  细胞和病毒
PK-15细胞由成都天邦生物制品有限公司研发部保存,PCV2临床株由成都天邦生物制品有限公司研发部分离鉴定并保存,PCV2大北农株(灭活疫苗用DBN-SX07 株)购于北京大北农集团。
1.1.3  酶和试剂    
2×Taq PCR MasterMix为Takara公司产品,DNA提取试剂盒(TIANamp Genomic DNA Kit)为天根公司产品,Goldview为赛百盛公司产品,细胞培养液为含10%新生牛血清(NCS)的DMEM溶液,PCV2阳性血清由成都天邦生物制品有限公司研发部制备保存,兔抗猪荧光二抗购于Sigma公司,其余试剂均为分析纯产品。
1.1.4  引物
国标引物为3条,扩增目的片段大小为1154bp;出入境引物为4条,扩增目的片段大小为260bp;研发引物针对PCV2标准毒株ORF2基因设计,扩增目的片段大小为727bp。引物均由大连TaKaRa公司合成,引物序列和扩增片段大小见表1。
表1    PCR引物序列及其扩增片段大小
Table 1   The sequences of PCR primers and the lengths of their amplified fragments
种类    名称    引物序列    长度    扩增片段大小
PCV国家标准引物    P1    5´-CCG CGG GCT GGC TGA ACT T-3´    19    PCV1  652 bp
PVC2  1154 bp
    P2    5´-CTC GGC TAT GCG CTC CAA AAT G-3´    22    
    P3    5´-ACC CCC GCC ACC GCT ACC-3´    18    
PCV出入境检验检疫标准引物    
nP1    5´-CAA CTG CTG TCC CAG CTG TAG-3´    
21    880 bp
    nP2    5´-AGG AGG CGT TAC CGC AGA G-3´    20    
    nP3    5´-TAG GTT AGG GCT GTG GCC TT-3´    20    260 bp
    nP4    5´-CCG CAC CTT CGG ATA TAC TG-3´    20    
PCV研发引物    
Y1    5´-GCC CGT GCC ACA TCG AGA AA-3´    
20    727 bp
    Y2    5´-GGG GGG GAA AGG GTG ACG AAC T-3´    22 三种不同引物扩增对猪圆环病毒2型检测敏感性的研究(2):http://www.youerw.com/yixue/lunwen_20834.html
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