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基于分子结构-香强度构香关系的普洱茶活性香气化合物的3D-QSAR研究(3)

时间:2022-02-13 20:38来源:毕业论文
1。2 研究现状 1。3 香气形成机理的研究进展 1。4 本课题的研究内容 本课题主要研究的是基于分子结构-香强度构香关系的普洱茶活性香气化合物的三维定

1。2 研究现状

1。3 香气形成机理的研究进展

1。4 本课题的研究内容

本课题主要研究的是基于分子结构-香强度构香关系的普洱茶活性香气化合物的三维定量构效关系。使用SYBYL-X2。0通过对所研究的一系列分子的结构进行搭建、优化、叠合、CoMFA和CoMSIA计算分析等方法对其化合物活性进行预测,调整,并根据所建立的模型的数据来观察各个物质的活性。再根据模型进行香味化合物的分析得出结论,设计新的具有香气活性化合物。在SYBYL-X2。0的使用过程中,叠合过后没有找到有效的公共基团,CoMFA和CoMSIA计算过程最佳组合数为3,不符合规定的6~10,相关系数规定是0。9~1,F检验值大于100,可是我的化合物由于相关性都比较小,达不到规定值,所以经过与老师的交流和讨论,决定换用另外的方法的进行接下来的工作。先用Gaussion03运行出各物质的量子化学参数,计算出各参数间的Pearson相关系数,用SPSS统计学原理,Stepwise法多元线性回归,建立模型得出方程,使得R、R2、SE、F、VIF、都在合格范围内,得出自变量计算值与实验值间的差值,设计几十种具有香气活性化合物。

本论文采用Chem3D12。0和ChemDraw12。0程序绘制分子几何构型。Gaussian 03量子化学软件的密度泛函理论(Density Functional Theory,DFT)进行化合物的优化过程。整个计算选取的是6-311G*基组。用B3LYP法完成从头计算。

将具有不同结构特征的普洱茶香气成分的香气强度进行比较,根据其建立的QSAR方程,对其香气强度值与各结构参数的关系进行理论分析和预测。

2 研究原理及方法

2。1 定量构效关系(Q-SAR) 

定量构效关系 (Quantitative Structure-Activity Relationships)研究的就是找出药物分子结构性质与它们活性之间的数学关系,应用这个关系来预测出活性较高的分子结构,达到设计新的药物分子的目的。QSAR主要是用于化合物的构建及其优化,是现代药物分子设计的重要手段,是分子设计发展路上的重要里程碑。论文网

定量构效关系主要有2D-QSAR和3D-QSAR两种方法。在药物、农药、化学毒剂等领域这两种方法被广泛地应用。在药物设计早期发展阶段,定量构效关系是设计分子最常用的方法,随着现代计算机技术不断地发展,各种分子结构的三维结构被准确测定。二十世纪九十年代,基于结构的药物设计开始发展起来,定量构效关系的主导地位就慢慢地发生改变,即使这样,我们仍然会说在药学研究中,定量构效关系有着巨大的影响力。

定量构效关系研究的基本过程主要有以下几个步骤:

第一,从前人的研究成果中收集药物活性数据;

第二,把活性较好的参数提取出来;

第三,将活性数据与计算所得的分子性质参数进行汇总;

第四,选择适当的分析方法准备建模;

第五,建立模型;

第六,对建立模型进行各方面的验证。

目前QSAR研究时主要表现出下面的几个特点:

综合性、理论性、智能化、程序化、实用化。

利用QSAR来研讨时,通常用药物产生固定的生物效应时的摩尔剂量或者摩尔浓度的负对数(log(1/C))的多少来表示生物效应的好坏。然而标准生物效应较多选取剂量-效应曲线的敏感部位,如产生50%最大效应药物的量浓度(ED50)、用酶抑制剂抑制50%专一结合的药物的量浓度半数抑制浓度(IC50)、半数效应浓度(EC50)、以及半数致死的摩尔量(LD50)等来表示。

药物研究时,首先就是要引入药物分子三维结构信息,为探究定量构效关系奠定基础。应用3D-QSAR伎俩,药物分子与大分子相互作用过程中两者之间会产生非键相互作用。与2D-QSAR比起来,它能表明出更加完善的信息量,物理意义也会更加明确。所以,随着时间的流逝,现代技术日趋完善,三维定量构效关系也有了质的飞跃,逐步成为了基于分子结构设计新药的主导地位。三维定量构效关系目前最常用的方法主要是比较分子力场法CoMFA和比较分子相似性法CoMSIA,其他的方法DG3D-QSAR、GERM、MSA等方法用的不是那么频繁。 基于分子结构-香强度构香关系的普洱茶活性香气化合物的3D-QSAR研究(3):http://www.youerw.com/yixue/lunwen_89673.html

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