在植物中，只有少数TIFY基因的功能得到了鉴定。拟南芥JAZ10/TIFY9受创伤胁迫和茉莉酸诱导，其超量表达使拟南芥对茉莉酸不敏感，且降低了由创伤胁迫所导致的生长抑制。Ye等[1]对水稻中的TIFY基因家族进行了研究，发现水稻中有20个TIFY基因，有9个基因在茉莉酸作用下表达量会发生变化，而几乎所有的该家族基因至少受一种非生物胁迫诱导。此外，OsTIFY11a的超量表达能够提高水稻对盐和干旱的耐受力。拟南芥和水稻中TIFY类基因的研究表明该植物特有的基因家族在植物非生物胁迫应答中起着重要的作用[2]。

水稻是世界上主要的粮食作物，我国一半以上的人口以稻米为主食。水稻也是单子叶植物分子生物学研究的模式生物。相较于拟南芥中TIFY基因家族的研究，水稻还处于初级阶段，很多基因的结构和功能都还未得到阐明。本研究采用生物信息学方法对水稻基因组中的TIFY基因进行了系统鉴定，并开展了分子进化和表达分析，旨在为该家族基因功能的进一步研究提供参考。

2  材料与方法文献综述

2。1  水稻TIFY基因家族成员的鉴定

从Pfam数据库（http://pfam。janelia。org）下载水稻TIFY结构域一致性序列，利用BLAST工具对水稻基因组注释数据库（Rice Genome Annotation Project Database, RGAP, http://rice。plantbiology。msu。edu/）进行搜索比对，得到候选蛋白；利用Pfam工具对候选的蛋白序列进行检索，若存在TIFY结构域，则将其作为家族成员[3]。利用Expasy protparam软件（http://web。expasy。org/protparam/）计算蛋白质氨基酸数目、等电点、分子量等信息，最后利用WoLF PSORT（http://www。genscript。com/psort/wolf_psort。html）网站预测蛋白质亚细胞定位。