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水稻DNA甲基转移酶基因家族的生物信息学分析(3)

时间:2024-01-24 22:49来源:毕业论文
3 结果与分析 3。1 水稻中的DNA甲基转移酶基因 利用DNA甲基转移酶结构域一致性序列在水稻基因组注释数据库(http://rice。plantbiology。msu。edu/standalone_blast。

3  结果与分析

3。1  水稻中的DNA甲基转移酶基因

利用DNA甲基转移酶结构域一致性序列在水稻基因组注释数据库(http://rice。plantbiology。msu。edu/standalone_blast。shtml)中比对搜索,剔除不含完整DNA甲基转移酶结构域的序列,最终鉴定出水稻中6个DNA甲基转移酶基因。根据基因在染色体上的位置将其系统命名为OsMET1-OsMET6,下载其基本信息列于表1。从表1可以看出,该家族基因外显子数目变化较大,从7-30个不等,说明水稻DNA甲基转移酶基因不是起源于逆转录转座。这6个基因的蛋白质氨基酸数差异较大,最大的是OsMET2,拥有1787 aa,最小的为OsMET1,仅有280 aa。蛋白质分子量从196868。84道尔顿到31317。54道尔顿不等。理论等电点范围为4。5573-9。5756,其中OsMET1、OsMET2的等电点都在5左右,是酸性蛋白;OsMET4为近中性蛋白;其他蛋白为碱性蛋白。利用WoLF PSORT工具预测水稻DNA甲基转移酶蛋白的亚细胞定位,发现有4个OsMET定位在细胞核中,有2个OsMET定位在细胞质中。基因转录方向分析表明,有3个基因是正向转录,有3个基因为反向转录。

水稻DNA甲基转移酶基因家族的生物信息学分析(3):http://www.youerw.com/shengwu/lunwen_201151.html
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