尽管这种方式有着投资小、见效快，对传统的管理模式触动较小，深受临床医护人员的欢迎等优点，但也着一些局限性。因为只停留在有限的电子病历文书处理上，尽管可以很好的实现入院记录、病程记录等医疗文书的计算机书写和管理，但如果缺少其他临床信息系统支持，则无法实现医嘱、病历、检查、检验、手术等信息的共享和联动，很多环节可能需要人工录入或重复采集，很难实现电子病历信息的全面共享和完整记录。只是效率得到了提升，流程暂时无法得到优化。
而且，如果把这种层面的电子病历系统当做医院临床信息化建设的一个亮点，则势必会影响医院信息化建设的后续投入，导致医院的临床信息化建设在很长的一段时间内停滞不前。
（2）基于电子病历的临床信息系统
基于电子病历的临床信息系统应用不仅仅关注医疗、护理文书的电子化书写和管理，而是将各个专业的信息系统，如PACS、LIS、手术麻醉、心电等信息系统和医生站进行整合，实现医嘱全流程的信息化。从而能将患者诊疗过程中各个环节所产生的诊疗信息转化成电子病历记录，实现完整的信息共享。
这一层面的电子病历应用，主要是用信息化的手段来服务于医院的管理模式的转变和服务流程改造，进而提升医院的管理水平和业务科室的工作效率。
当然，这一层面的信息化建设，不但需要有充裕的资金支持，而且要有科学合理的规划，对医院管理模式和业务流程的影响也非常大。当电子病历应用贯穿各个专业的临床系统时，信息的标准化、各系统间的集成需要重点考虑。一个很好的思路是首先建设一个医院信息系统集成平台，然后在这个平台上实现各专业系统的集成和数据的交换。这样才能确保临床信息系统建设的高起点和最终完整的应用。
3、不同医院临床信息化建设动因分析
医院的规模不同、定位不同决定了医院将采用不同的发展战略。而信息化的建设的思路也要服务于医院的定位和发展战略，不同的建设思路背后有着不同的原因。
据不完全统计，采用第一种建设模式的医院多为中小型医院，以二级医院为主。而采用第二种建设模式的医院，多为大型医院，以大型三级综合性医院为主。
二级医院，比如数量众多的县市级医疗机构，是人民群众日常医疗保健优先选择的医疗机构。因为这些医疗机构拥有较全的学科，而且地域分布广、就诊便利、费用也相对低廉，一般的多发病、常见病都能够得到较好的诊治。加之在居民医保、新农合等全民医保政策的推动下，基层医疗机构吸引了大量的病人。
近年来多数二级医院的住院病人量节节攀升，临床医护人员的工作量不断加大，迫切需要通过信息系统应用来提高工作效率。应用电子病历系统来改变病历手工书写的方式、提高病历的规范性成为医护人员最普遍的呼声。 毕业论文http://www.youerw.com
因此，面对一直都投入不足的建设资金、尚待完善的技术标准和有待明确的法律规范，二级医院临床信息化建设的首选目标大多集中在提高医护人员的工作效率和提高病历的规范性上，之后才是全面的临床信息系统建设。所以建设一个性能良好、功能完善的电子病历文书书写和管理系统成为了很多医院直接的选择。
而三级医院，特别是大型综合性医院，往往是一个区域内的医疗中心，拥有最具优势的医疗资源，在重症和疑难杂症的诊断和治疗上最具优势，拥有诸多的特色和重点专科，医护人员整体水平高。患者在三级医院可以得到非常全面的检查、诊断、治疗，使得三级医院往往成为有条件的患者和疑难病症患者的就医首选。这在很大程度的造成了大型医院看病难、就诊流程三长一短的现象。因此，当前三级医院对管理创新和流程优化的需求非常迫切。
三级医院大多都有着良好的信息化应用基础，往往要求建立一个以电子病历为中心，覆盖门诊、临床、检查、检验、病理、手术、护理等各个诊疗环节的临床信息系统。不但要提高工作效率，而且还要能优化诊疗流程、提升服务水准、加强科研能力、提高医院在区域内的影响力和竞争力。
而三级医院相对二级医院而言，信息化建设的资金、技术、人才都相对充裕，加之大型医院的定位，使得电子病历系统应用从一开始就集中在全面完整的临床信息系统应用之上，因此在电子病历系统建设时，更多的应该考虑医生工作站的建立和检查、检验、病理、手术、用药信息的共享和整合上。单纯的电子病历文书应用并不多见于三级医院，而融合影像、检验、病理、手术麻醉信息的完整电子病历应用，成为了多数三级医院临床信息化建设的重点。
综上所述，基于电子病历的临床信息系统建设尽管有着不同的建设思路和应用效果，但需要充分结合医院自身的情况和业务的需要，分清主次，有所为有所不为的进行信息化建设，才能将信息化建设和应用真正服务于医院的经营管理和战略发展